Объясните, почему и как возникли города: почему ремесленники и торговцы уходили…

В какое именно время? Если в Смуту (15-16 в.), то потому, что всех настигал кризис — многие уходили из страны, наступал голод — все зарабатывали как могли. Ремесленники же начали производство на заказ, в последствии чего появились Инфакстунктуры (точно не помню как пишется; D). А значит, начинали появлятся первые крупные торговцы, промышленники; начал развиваться Государственный рынок (или всероссийский), соотвестсвенно, чтобы увеличть торговлю, могли создаваться города (села).